Los Laboratorios Hospitalarios del "Hospital de Terrassa", "Hospital Universitari de Mútua de Terrassa" y de la "Fundació Hospital Sant Joan de Déu de Martorell" funcionan 24 horas 365 días al año. Estos laboratorios trabajan en red como laboratorios de urgencias junto al laboratorio central en Viladecavalls, disponen de los mismos analizadores y comparten protocolos de trabajo.

El concepto de Laboratorio Hospitalario abarca tanto las Urgencias médicas del Hospital como la Microbiología hospitalaria. Desde el Laboratorio de Urgencias se realizan las determinaciones urgentes básicas de bioquímica, hematología y gasometrías que también incluyen, entre otros, marcadores cardíacos, fármacos y drogas de abuso y serología infecciosa. La bioquímica se realiza con módulos de analizadores espectrofotométricos, inmunoquímicos y módulos ISE, y la hematología con sistemas Sysmex XN. En el Laboratorio hospitalario de Microbiología se realiza la bacteriología del paciente ingresado y las técnicas de Biología Molecular urgentes, disponiendo del equipamiento necesario para realizar cultivos, identificaciones, antibiogramas y técnicas moleculares. Desde el laboratorio hospitalario también se gestionan equipos POCT, como gasómetros, que puedan estar instalados en distintas localizaciones de los hospitales.
Además, en los hospitales de Terrassa y Sant Joan de Deu de Martorell el laboratorio es responsable del Banco de Sangre, donde se realiza el seguimiento de las bolsas de sangre y plasma y se realizan las pruebas de laboratorio necesarias para su correcto funcionamiento.