L’àrea de Microbiologia Clínica té una funció multidisciplinària. La seva activitat principal consisteix en el diagnòstic de malalties infeccioses en les mostres biològiques recollides del pacient. Es disposa tant de tècniques ràpides com la detecció d’antígens o PCRs urgents com de tècniques més convencionals com el cultiu i l’antibiograma, per conèixer la sensibilitat o resistència als agents antimicrobians
L'àrea de Microbiologia està repartida en quatre laboratoris, tres dins dels propis centres hospitalaris (Hospital Universitari Mutua de Terrassa, Hospital Universitari Consorci Sanitari de Terrassa i Fundació Sant Joan de Déu de Martorell) i un laboratori central de referència a Viladecavalls.
Als laboratoris hospitalaris es realitza la microbiologia urgent (tant bacteriologia com molecular) i es processen les mostres del pacient ingressat. També es realitzen els estudis de les infeccions relacionades amb l’assistència sanitària, de controls ambientals i de colonització de microorganismes multirresistents. Des del laboratori també es participa en diferents grups de treball i comissions hospitalàries, essent el seu treball essencial als grups PROA (Programes d’Optimització de l’Ús d’Antibiòtics).
El laboratori central de referència està situat a Viladecavalls. És el laboratori on es centralitzen totes les determinacions procedents d’atenció primària. Consta de les àrees següents:
